起動スクリプトの記載を誤り、サーバーが起動しなくなってしまいました。

コンソール機能をご利用いただくことで、お客様にて対処可能かと思われます。
コンソールの接続方法については、以下URLをご覧ください。

【コンソールに接続する:Linux系OSの場合】
https://cloud.nifty.com/guide/cp/login/console_linux.htm

【コンソールに接続する:Windows系OSの場合】
https://cloud.nifty.com/guide/cp/login/console_windows.htm